Современный ландшафт Нидерландов складывался не одно столетие, в процессе его формирования важную роль играли особенности геологического строения. Страна находится в пределах Североморской низменности, включающей также часть Бельгии, северной Франции, северо-западной Германии, западной Дании и восточной Англии. Эти территории испытывают погружение, достигающее максимальных масштабов в Нидерландах. Этим объясняется преобладание низких абсолютных высот на большей части страны и подверженность наводнениям. Кроме того, во время последнего материкового оледенение на северо-востоке и в центральной части Нидерландов накапливались песчаные и галечниковые толщи, а в краевой зоне ледникового покрова образовались невысокие напорные моренные гряды.

За пределами области оледенения на юге Нидерландов, быстрые реки Рейн и Маас отложили мощные песчаные толщи. Временами, когда уровень моря понижался, эти реки вырабатывали более глубокие русла; при этом формировались речные террасы и невысокие междуречья, характерные для южных провинций. По окончании ледникового периода на побережье страны образовались песчаные дюны, а за ними – обширные мелководные лагуны, которые постепенно заполнялись аллювиальными и морскими отложениями; впоследствии там возникли болота.

На современном этапе ниже уровня моря расположено более половины территории страны (33,9 тыс. кв. км), включая почти все западные земли – от провинции Зеландия на юго-западе до провинции Гронинген на северо-востоке. Голландцы начали отвоевывать эти территории у моря еще в 13 в. и сумели превратить в продуктивные пахотные угодья. Такая земля называется польдеры. Участки болот и мелководий были огорожены дамбами, вода откачивалась вначале с помощью энергии ветряных мельниц, а позднее паровыми и электрическими насосами. Уровни крупных рек страны в их нижних течениях нередко располагаются выше окружающих междуречий, сложенных рыхлыми осадками, и естественной защитой от наводнений являются береговые валы, которые укрепляют дамбами. С высоты птичьего полета осушенные территории, называемые польдерами, представляют собой сложную мозаику с многочисленными канавами и каналами, разделяющими поля и обеспечивающими сток.

С 1927 г. в Нидерландах началось осуществление крупного гидротехнического проекта по осушению залива Зёйдер-Зе. К 1932 г. было завершено строительство основной дамбы длиной 29 км, которая пересекла этот залив на участке между провинциями Северная Голландия и Фрисландия. В последующие пять лет выше этой дамбы образовалось пресноводное озеро Эйсселмер, которое намечалось осушить. В первую очередь был создан польдер Вирингермер на северо-западе, затем – Уркерланд на северо-востоке. Таким же способом были осушены территории Восточного и Южного Флеволанда. В конце 1980-х годов завершилось осушение Маркерварда.

Выше уровня моря в Нидерландах расположены территории песчаных береговых дюн, плоские и слабохолмистые равнины преимущественно на востоке и юге страны, а также меловое плато на крайнем юго-востоке, именно здесь находится самая высокая точка страны гора Валсерберг (321 м над уровнем моря).